Uge 3

Tirsdag den 12. maj 2020. Kl. 17.15-20.00

• Zoom link: https://ucph-ku.zoom.us/j/66316980428?pwd=WENWN1FYR2N1T2RiOXlBLzY3MmVIQT09

• Inden undervisningen:

  • Læs resten af kapitel 4-5 fra noterne.
  • Følg de første 3 kapitler af kurset “Multiple and Logistic Regression in R” fra DataCamp.

• Slides Slides til dag 3 ligger her.

• Videoer Del 1 og del 2.

• Øvelser: Løsningskommentarer til opgaverne er her

  1. I denne opgave skal vi undersøge sammenhængen mellem lungekapacitet, FEV, (forced expiratory volume) og rygning. Datasættet findes i biblioteket stat4med og hedder fev. Data kan indlæses ved at køre

     library("stat4med")
     data(fev)

     hvorefter datasættet fev er tilgængeligt. Hvis du ikke har mulighed for at indlæse pakken, så kan datasættet hentes direkte fra nettet ved hjælp af ordren

     fev <- read.csv(url("http://biostatistics.dk/puff/data/fev.csv"), header=TRUE)

     1. Lav en analyse, hvor FEV afhænger af, hvorvidt børnene ryger. Giv en fortolkning af estimaterne fra modellen, og formuler din konklusion i ord. Stemmer resultatet overens med hvad du ville forvente?
     2. Tilføj variablen Age til modellen fra foregående spørgsmål og få R til at estimere parametrene. Hvordan ændrer parametrene sig i forhold til før og hvorfor?
     3. Opskriv udtrykket for regressionsmodellen med de estimerede parametre. Hvilken fortolkning har de tre parametre?
     4. Brug udtrykket for den estimerede model til at prædiktere lungekapaciteten for følgende personer, og tænk over resultaterne i forhold til den opstillede model:
        • En 12-årig, der ikke ryger
        • En 12-årig, der ryger
        • Forskellen i liter mellem en 13-årig, der ryger og en 15-årig, der ikke ryger
     5. Har rygning betydning for lungekapaciteten?
     6. Tilføj nu også interaktionen mellem sex og age til modellen, og få R til at estimere parametrene. Opskriv udtrykket for regressionsmodellen med de fire estimerede parametre.
     7. Hvad beskriver parameteren for interaktionsleddet? Er der signifikant interaktion mellem alder og rygning? Forklar, hvad det betyder for fortolkningen af modellen, når interaktionen er signifikant forskellige fra nul. Forklar også, hvad det betyder, hvis den ikke er signifikant forskellig fra nul.
     8. Brug udtrykket for den estimerede model med vekselvirkning til at prædiktere lungekapaciteten for følgende personer:
        • En 12-årig dreng, der ikke ryger
        • En 12-årig pige, der ryger
        • Forskellen i liter mellem en 13-årig, der ryger og en 15-årig, der ikke ryger.
     9. Sammenlign disse resultater med de tilsvarende beregninger for modellen uden interaktionsleddet. Hvordan forklarer du forskellen? Hvilke af de to modeller vil du bruge prædiktionerne fra i praksis?

  2. I denne opgave vil vi gerne beskrive niveauet af hormonet AMH (højt niveau af dette hormon afspejler mange umodne follikler i æggestokkene, og dermed høj fertilitet). Den primære hypotese er at se på afhængigheden af alder, samt effekten af, hvorvidt kvinden indtager P-piller.

     Datasættet amh, der kan hentes via load(url("http://biostatistics.dk/puff/data/amh.rda")). Datasættet indeholder fem variable: alder (målt i år), amh (målt i pmol/l), ppiller (tager kvinden p-piller, 0=nej, 1=ja), rygning (ryger kvinden, 0=nej, 1=ja), og bmi i tre grupper (undervægtige, normalvægtige og overvægtige).

     Analyser data.